Jusqu'au début du XXe siècle, Santorin a bénéficié d'un commerce maritime florissant et possédait l'une des plus grandes flottes marchandes de la mer Égée. Les principales exportations de l'époque étaient le célèbre vin de Santorin, les tomates et les textiles (surtout le coton). Cependant, l'invention des navires à vapeur a entraîné le déclin partiel de l'industrie maritime existante.

Après le déclenchement de la Seconde Guerre mondiale en 1939, la Grèce est d'abord restée neutre, mais la pression du régime fasciste italien s'est accrue. Au fil du temps, les troupes allemandes et italiennes ont occupé l'île de Santorin et y sont restées jusqu'à la fin de l'occupation en octobre 1944. Dans les villages de Pyrgos et de Karterados, on trouve des plaques commémoratives à la mémoire de ceux qui sont morts pendant la Seconde Guerre mondiale.

Le tremblement de terre de 1956 et l'éruption volcanique qui a suivi ont été une catastrophe économique et sociale pour l'île de Santorin. Le tremblement de terre a gravement endommagé les infrastructures de l'île, la plupart des bâtiments ont été détruits et la population locale a fortement diminué (de nombreuses personnes ont perdu la vie et d'autres ont déménagé par la suite). Malheureusement, l'île a également subi des pertes irréparables dans le domaine des monuments historiques. La grande majorité des bâtiments de la belle ville de Fira ont été détruits et la ville d'Oia a même été rasée et a dû être reconstruite. Cette catastrophe a ramené l'île de Santorin à l'époque de la pauvreté et de la misère.

Ce n'est que dans les années 1970 que l'île a commencé à renaître, lorsque l'attention s'est portée sur l'industrie touristique en plein essor, qui représente aujourd'hui la plus grande partie de l'économie de l'île. Une autre industrie importante reste la production de vin, qui était autrefois florissante ici grâce au sol volcanique fertile et qui a été modernisée après 1956.

Aujourd'hui, l'île grecque de Santorin est l'une des destinations touristiques les plus populaires au monde. Des milliers de touristes s'y rendent chaque année pour découvrir le caractère unique de cette île volcanique, notamment la caldeira formée, les plages volcaniques et les couchers de soleil à couper le souffle. Santorin est également un lieu populaire pour les cérémonies de mariage et les lunes de miel.