Domination vénitienne

En 1204, l'île de Théra (comme les autres îles de la mer Égée) passe aux mains d'un Vénitien nommé Marco Sanudo et fait ainsi partie du duché de Naxos (ou duché de la mer Égée). Un important dirigeant de l'île était Giacomo Barozzi, le baron vénitien de Santorin et de Thirasia, dont les descendants ont régné sur l'île jusqu'en 1480. Le duché est ensuite annexé à Venise en 1487.

Les Vénitiens ont donné à l'île un nouveau nom en l'honneur de leur sainte patronne, Sainte Irène ("Santa Irini"), et c'est ainsi que l'île de Santorin a été créée. Plusieurs nouveaux bâtiments ont ensuite été construits sur l'île en mémoire de Sainte Irène, dont la belle basilique de Santa Irini (datant de 1477).

Cependant, la période de domination vénitienne a été marquée avant tout par des luttes constantes avec les bandes de pirates et, dans une moindre mesure, par des rivalités entre les souverains locaux. Cette atmosphère tendue a conduit à la création de cinq établissements fortifiés (castellations), situés à des endroits stratégiques et équipés de portes et de tours de guet. Bien que ces castellations aient été gravement endommagées par le tremblement de terre de 1956, leurs vestiges ont survécu jusqu'à aujourd'hui et constituent désormais des points de repère intéressants sur l'île de Santorin. Il s'agit du château de Skaros (dans l'actuel Imerovigli), du château de Pyrgos, du château d'Emporio, du château d'Akrotiri (Punta Castelli) et du château d'Agios Nikolaos (ou Apanomerias) dans la ville d'Oia.

Domination turque

Au fil des ans, les souverains vénitiens sont parvenus à négocier un certain nombre de traités de reconnaissance de l'Empire ottoman. Cependant, cela n'a pas empêché les raids turcs et, en 1579, l'île de Santorin a finalement été conquise par l'amiral ottoman Piyale Pasha. Les Turcs appelaient l'île "Dermetzik", qui se traduit par "petit moulin" (probablement en raison des nombreux moulins de Santorin). Pendant la guerre russo-turque (qui s'est déroulée dans la seconde moitié du XVIIIe siècle), l'île est brièvement passée sous la domination russe, mais elle est rapidement repassée sous le contrôle des Turcs ottomans.

À l'époque de la domination turque, l'île n'avait plus à faire face aux attaques de pirates et avait construit sa propre flotte de marine marchande. Santorin a ainsi développé avec succès ses relations commerciales avec les principales villes portuaires de la Méditerranée orientale et a réussi à maintenir sa position privilégiée au cours du siècle suivant. Par exemple, on trouve encore aujourd'hui sur l'île des manoirs datant de cette période, qui témoignent du niveau de vie élevé de la population locale.

Indépendance de Santorin

Après le déclenchement de la guerre d'indépendance grecque, qui a débuté en mars 1821 en Grèce continentale, l'île de Santorin a fait de même en mai, bien que l'Église catholique locale ait émis des réserves à ce sujet. La flotte navale de Santorin était très puissante et a joué un rôle important dans la guerre d'indépendance grecque. L'île de Santorin a finalement fait partie du royaume indépendant de Grèce en 1832 (avec la signature du traité de Constantinople).